新疆第二医学院是一所由自治区人民政府直接领导和管理的、独立设置的本科层次公办普通高等学校，坐落于我国重要的石油石化工业基地——新疆克拉玛依市。学院定位于应用型高等学校，以医学类为主，理学、管理学等多学科协调发展，主要培养区域经济社会发展所需要的高素质应用型、技术技能型人才。
学院前身为新疆医科大学厚博学院，创办于2003年，是依托新疆医科大学综合办学优势举办的全日制普通本科独立学院。2012年，经自治区人民政府批准，新疆医科大学与克拉玛依市以合作办学的方式共同建设厚博学院。2015年，厚博学院整体迁建至克拉玛依市。2021年1月，国家教育部批准同意新疆医科大学厚博学院转设为新疆第二医学院。
学院现开设临床医学、口腔医学、中西医临床医学、麻醉学、护理学、药学、医学影像技术、医学检验技术、卫生检验与检疫、信息管理与信息系统以及公共事业管理等11个专业，面向全国21个省、市、自治区招生。办学18年以来，学院教学质量稳步提升，录取率接近100%，连续三年报到率超过90%，为全国累计输送毕业生8400余名，毕业生考研率稳定在10%左右，不少毕业生考入复旦大学、浙江大学、同济大学、北京中医药大学等双一流院校，得到了社会各界特别是同行的广泛认可，为新疆医疗卫生事业发展作出了积极贡献。
学院规划总面积1100余亩，总建筑面积超过24万平方米，实验教学楼、图文信息中心、体育馆、学生公寓楼等基础设施全部达到本科院校合格办学标准，教学条件和服务设施达到国内同类院校的一流水平。
目前学院在校学生接近5000人，远期规划办学规模为10000人。今后学院将坚持“立足新疆、服务西部、辐射丝绸之路沿线国家”的服务面向定位，建设以临床医学为主、理学和管理学为辅的学科体系，大力发展全科医学、护理学、医学技术类专业，适度发展公共卫生与预防医学类专业，构建医理、医药、医管等交叉融合、相互支撑、协同发展的专业布局，努力把学院打造成为在西部具有一定影响力，办学特色鲜明的高水平、区域性本科医学教育高地。
